- Piégeage mécanique. Les matières en suspension et les pathogènes sont physiquement pris au piège dans les espaces entre les grains de sable.
- Prédation. Les pathogènes sont consommés par d'autres microorganismes dans la biologique.
- L'adsorption. Les pathogènes sont attachés les uns aux autres, aux matières en suspension dans l'eau, et aux grains de sable.
- La mort naturelle. Les pathogènes terminent leur cycle de vie ou meurent parce qu'il n'y a pas assez de nourriture ou d'oxygène pour leur survie.
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